Keď sa Kubo s mamou a sestrou Vierkou presťahuje z mesta na vidiek, v novom domove sa mu vôbec nepáči. Nič nie je také, ako bol zvyknutý, chýbajú mu svetlá a zvuky mesta, dokonca aj hluk od susedov, nehovoriac o kamarátoch, ktorých tam nechal... a čo je najhoršie, v dome sa začnú diať čudesné veci.
V dedine koluje povesť o maličkom chlpatom stvorení zvanom nuka, ktoré žije v hlbinách vrchu za Kubovým domom a v noci občas vychádza von a vystrája huncútstva. Kubo na nuky neverí. Kto kedy počul o takom stvorení?
V hlbinách vrchu však naozaj žije maličký tvor, ktorý cíti Kubovu osamelosť ako nepríjemné šteklenie vo fúzikoch a túži mu pomôcť. Chce smutného chlapca nájsť a rozveseliť. Podarí sa mu to? Nájde Kubo znova svoju iskru?